員工一年因遲到被扣20萬工資是不合法的^[1]^。

遲到是屬于員工違反公司規(guī)章制度的行為，用人單位可以扣工資，但不得超過當月工資的20%，若用人單位扣除了勞動者應得工資，那么用人單位侵犯了勞動者的合法權益，作為勞動者可以向勞動監(jiān)察部門投訴用人單位^[1]^。

勞動法沒有規(guī)定遲到扣20%工資，扣錢是合法的，但是扣20%工資是不合理的，勞動者可以與用人單位協(xié)商達成一致，或者向勞動監(jiān)察大隊投訴，向法院提起勞動爭議訴訟等辦法維護自己的合法權益^[3]^。